Akcja ATOM RPG: Trudograd toczy się dwa lata po wydarzeniach przedstawionych w pierwowzorze. Gracz trafia do tytułowego postsowieckiego miasta, które przetrwało atomową wojnę mającą miejsce blisko ćwierć wieku temu. Jego zadaniem jest znalezienie sposobu na rozprawienie się z niebezpieczeństwem z kosmosu zagrażającym resztkom ludzkości.

Pomimo że historia przedstawiona w opisywanym dodatku kontynuuje wątki rozpoczęte w podstawowej wersji gry, znajomość pierwowzoru nie powinna być konieczna, gdyż autorzy zadbali o właściwe zapoznanie nowych w temacie graczy ze światem przedstawionym. Mimo wszystko twórcy zachęcają, by najpierw sprawdzić „podstawkę”, a dopiero później zagrać w dodatek